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「质」敬未来:Zoom 视角下的 Orbitrap Astral 质谱仪解锁生物宇宙的多重可能-2

发布时间:2025-06-10 16:34 |  点击次数:612

「质」敬未来:Zoom 视角下的 Orbitrap Astral 质谱仪解锁生物宇宙的多重可能-2

Orbitrap Astral Zoom 质谱仪新增了 low input 应用模式,对比标准模式,单离子检测概率提高 10%。单细胞蛋白组应用中,可在 250 pg Hela 肽段中鉴定 6500+ 蛋白,三次分析 CV 值小于 6%;单个 HEK293F 细胞中平均鉴定约 5800 个蛋白(图 7)。其它低上样量样本的分析同样可使用该模式,包括免疫多肽分析,单细胞空间蛋白组分析等。

「质」敬未来:Zoom 视角下的 Orbitrap Astral 质谱仪解锁生物宇宙的多重可能-2

7Orbitrap Astral Zoom 质谱仪分析不同上样量的 Hela 肽段及单个 HEK293F 细胞的鉴定结果(分析中不使用谱图库)

除了非标定量的单细胞蛋白组流程之外,Orbitrap Astral Zoom 质谱仪还可进行基于 TMT 标记的单细胞蛋白组流程。Astral 质量分析器中的转向棱镜通过控制离子的振荡循环次数,延长非对称轨迹的长度,将 Astral 的分辨率提升至100,000(图 8),可允许使用 TMTpro 32/35 标试剂进行标记分析流程,进一步提高分析通量。

「质」敬未来:Zoom 视角下的 Orbitrap Astral 质谱仪解锁生物宇宙的多重可能-2

8TMT HR 模式时,Astral 分辨率提升至100,000m/z 138

「质」敬未来:Zoom 视角下的 Orbitrap Astral 质谱仪解锁生物宇宙的多重可能-2

精准定量对分析生物样本丰度变化的统计学显著性十分重要。图9展示了三个蛋白组的混合样品(人,酵母,大肠杆菌肽段)中,从 pg ng 总上样量的 LFQ HR-DIA 分析中的定量准确性和精确性,可见所有上样量中均可实现高定量性能。

「质」敬未来:Zoom 视角下的 Orbitrap Astral 质谱仪解锁生物宇宙的多重可能-2

9,三个蛋白组的混合样品(人,酵母,大肠杆菌肽段),总上样量 100 pg 500 ng 时的定量性能

另外,Orbitrap Astral Zoom 质谱仪还新增了 HybridDIA 方法,在进行 DIA 采集的同时进行特定靶标的 MS2 采集,其靶标采集策略类似 surequant 模式,可智能触发目标肽段的采集,并有效提高靶标肽段的分析灵敏度。

「质」敬未来:Zoom 视角下的 Orbitrap Astral 质谱仪解锁生物宇宙的多重可能-2

Orbitrap Astral 平台相比,Orbitrap Astral Zoom 质谱仪可实现更快的阶梯能量碎裂,相关的主要应用包括糖基化肽段分析,化学交联肽段分析,以及未知小分子结构鉴定等,可提高鉴定深度,以及鉴定的可信度。

「质」敬未来:Zoom 视角下的 Orbitrap Astral 质谱仪解锁生物宇宙的多重可能-2

10,糖肽分析中,对比不同碎裂模式时的鉴定及打分值

10 中对比了不同能量模式下,小鼠脑组织的糖肽分析结果。虽然两种模式得到的糖肽位点和糖肽数量类似,但是阶梯能量碎裂模式对应的打分值更高,可信度更高。

在另一个场景下,使用阶梯能量碎裂进行大肠杆菌核糖体蛋白的交联分析,结果如下图11所示。对比其它两个平台,Orbitrap Astral Zoom 质谱仪所得的交联肽段及对应的谱图数都实现了提升。

「质」敬未来:Zoom 视角下的 Orbitrap Astral 质谱仪解锁生物宇宙的多重可能-2

11,大肠杆菌核糖体蛋白使用 DSSO 交联后,不同平台所得的鉴定结果

「质」敬未来:Zoom 视角下的 Orbitrap Astral 质谱仪解锁生物宇宙的多重可能-2

Orbitrap Astral Zoom 质谱仪选配了生物制药选项后,不仅与 Orbitrap Astral 相同,质量范围可从6000 扩展到 8000,进行变性和非变性条件下的完整蛋白分析;还可以在 Astral 中完成 ms2 扫描,进行 top-downmiddle-down 分析(图 12)。

「质」敬未来:Zoom 视角下的 Orbitrap Astral 质谱仪解锁生物宇宙的多重可能-2

12Astral 质量分析器可进行蛋白的topdown 分析,以 CAII 为例

基于 Orbitrap Astral 平台的高扫描速度高分辨率高灵敏度等性能特点,以及新模式、新方法的加入,赋于 Orbitrap Astral Zoom 质谱仪更多的可能性,也期待在后续的文章中和大家分享更多的细节和新的应用可能性。 

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